先天性白内障是儿童视力障碍的最常见原因之一。尽管传统上，出生时患有先天性白内障的患者接受一些代谢和感染筛查但很少找到致病原因，但最近的研究发现下一代测序（NGS）方法具有较高的阳性诊断诊断率。在先天性白内障患者中，通过NGS策略的诊断避免不必要的检查、监测和处理额外的相关表现、减少预后的不确定性和为家庭提供生育信心，提供了重要的临床价值。尽管取得了这些进展，但仍有30%~40% 的先天性白内障散发病例和家族性病例在基于微阵列和panel或外显子组测序（ES）的方法后仍然没有获得明确的基因诊断。随着使用包括拷贝数变异（CNV）和结构变异（SV）分析的全基因组测序（WGS）已经变得更容易获得和稳健，本文希望测试WGS对诊断产量和临床效用的影响。

这是接受WGS的先天性白内障患者队列中的第一个大型国际报告，证明了使用WGS的额外诊断和益处。

入组患者

对20名在出生后一年诊断为明显非综合征型先天性白内障的先证者进行了测序分析，其中6例患者之前未进行任何基因检测，14例患者已经进行了各种Panel、WES或基因芯片检测但结果为阴性。8例为散发，12例有家族史。

分析方法：略

结果

4例患者具有在WES上难以检测的致病小SV（患者2、6、19和20），而1例患者在GC rich区域具有突变，在先前的WES上的覆盖度较差（患者18）。在两个病例中，由于本研究中使用的扩展基因列表而获得了诊断（患者1和5），而在先前未调查的病例中检测到已知疾病基因中的SNV（患者17）。

在研究者最初的46例患者队列研究中，现在解决了36例，再加上6例中的4例，综合总检出率为77% （40/52）。

全基因测序（WGS）在基因组的GCrich和重复区域检测常见的PITX3插入和MAF突变。

全基因测序检测到染色体微阵列检测不到的MIP和NHS中的小缺失。如下图