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廖宁教授团队研究:中国早期乳腺癌患者基因组变化特征

2021-05-21 17:03:29来源:SIBCS
不同的基因组变化特征,包括ERBB2基因扩增,PIK3CAAKT1ESR1基因突变以及肿瘤基因突变率,已经成为乳腺癌治疗选择的重要生物标志。中国患者与西方患者相比,乳腺癌发病年龄较早,而且分子亚型分布独特,激素受体阳性比例较高,三阴性比例较低,故有必要对其基因组变化特征进行分析。

2021年4月21日,瑞士《肿瘤学前沿》在线发表广东省医学科学院广东省人民医院肖伟锴、张国淳、陈博、陈小清、温灵珠、赖建国、李学瑞、廖宁等学者的研究报告,调查了中国乳腺癌患者常见癌基因突变特征和肿瘤突变率。

该单中心队列回顾研究利用520个癌症相关基因组成的高灵敏多基因试剂盒,对广东省人民医院589例中国早期乳腺癌患者肿瘤标本及其对应血液标本进行测序,分析所有类型的基因组变化,并推算肿瘤基因突变率。

结果发现,I期、II期、III期乳腺癌分别占23.3%、55.9%、20.9%,激素受体阳性HER2阴性、HER2阳性、三阴性分别占73.3%、29.7%、11.5%。

T3~T4期与T1~T2期的肿瘤相比:

  • 9个基因(LPR1B、EGFR、POLE、PTPRT、KAT6A、HIST1H3C、LATS1、SDHA、SRC)突变率显著较高(P<0.05)

  • 9个基因(MYC、BRIP1、NBN、CD79B、PREX2、RUNX1T1、PRKAR1A、PRKDC、PTK2)扩增率显著较高(P<0.05)

淋巴结转移与未转移的患者相比:

  • 2个基因(POLE、TET2)突变率显著较高(P<0.05)

  • 4个基因(GATA3、FOXA1、ANKRD11、RET)突变率显著较低(P<0.05)

  • 10个基因(ERBB2、CDK12、CCND1、RPS6KB2、AURKA、FGFR2、PRDM1、CDK4、CHD2、FANCI)扩增率显著较高(P<0.05)

  • 2个基因(PIK3C2G、CCND2)扩增率显著较低(P<0.05)

年龄≤35岁与>35岁的患者相比:

  • 1个基因(EZH2)突变率显著较高(P<0.05)

  • 2个基因(PIK3CAMAP3K1)突变率显著较低(P<0.05)

  • 12个基因(PRKDC、RUNX1T1、IGF1R、IRS2、NTRK3、CARD11、FGFR3、LATS1、MEN1、PIK3CG、PPP6C、TRRAP)扩增率显著较高(P<0.05)

5.7%的肿瘤基因突变率>10个突变/百万碱基。

虽然中国队列与美国癌症基因组图谱TCGA研究乳腺癌队列相比,各种分子亚型乳腺癌的肿瘤基因突变率相似,但是与TCGA研究非洲裔美国人队列相比,激素受体阳性HER2阴性、三阳性、三阴性乳腺癌的肿瘤基因突变率显著不同。

中国队列与TCGA研究乳腺癌队列相比:

  • 诊断时年龄较早:中位48岁比58岁(P<0.001)

  • 三阴性比例较低:11.5%比18.4%(P<0.001)

  • 小叶浸润癌较少:2.4%比19.0%(P<0.001)

进一步亚组分析表明,该队列与与TCGA研究队列相比,年龄≤35岁、三阴性或小叶浸润癌患者的TP53ERBB2PIK3CA等基因突变率显著不同。

因此,该研究结果表明,中国患者早期乳腺癌各种分子亚型的基因突变特征独特,东西方早期乳腺癌存在显著差异。